Genomredigering i miljön – teoretisk analys av möjliga risker för off-targets i andra arter

I en studie uppmanas det till försiktighet vid användande av tekniker för genomredigering i en okontrollerad miljö. Man påtalar vikten av rigorös bedömning av risk för oavsiktliga genetiska förändringar i målorganismen, men också för risken att andra organismer i miljön genomredigeras. I studien har man använt dataanalyser för att identifiera möjliga DNA-sekvenser i icke-mål-organismer, så kallade off targets, som skulle kunna nås av en CRISPR/Cas-behandling i miljön.

Analysen utgick från sekvenser som ursprungligen konstruerats för RNA-interferens (RNAi, nedreglering av genuttryck genom RNA-basparning) och byggde på bioinformatiska simuleringar av hypotetiska scenarier där CRISPR/Cas (med RNAi-sekvensen som guide-RNA) antogs spridas i öppna miljöer. Sekvensen för basparning tillät fyra nukleotiders fel-matchning. Resultaten visade förekomst av sekvenser som de analyserade guide-RNA-sekvenserna (RNAi-sekvenserna) möjligen skulle kunna binda till i genom hos flera undersökta arter.

Författarna menar att den här potentiella bindningen indikerar att CRISPR/Cas riskerar att orsaka oavsiktliga mutationer i de här arterna. Studiens värde begränsas av att den bortser från flera väsentliga biologiska parametrar, till exempel hur CRISPR/Cas skulle kunna ta sig in i de andra arternas celler, och ger därför begränsad evidens för verkliga miljöeffekter. Studien kan dock vara relevant som en teoretisk analys av värsta tänkbara scenario och som underlag för tidig riskidentifiering i policy-sammanhang.